267 ورقة بحثية
تقدم هذه الورقة استراتيجيتين للضبط أثناء الاستدلال دون الحاجة لإعادة تدريب، وهما "الاستيفاء-التكامل" (Interpolate-Integrate) و"توجيه الاستبدال" (Replacement Guidance)، لنماذج مطابقة التدفق المتوافقة مع التماثل (E(3)-equivariant) لتمكين تصميم الروابط ثلاثية الأبعاد ذات البدائل الحيوية بكفاءة وجودة عالية دون الحاجة لإعادة تدريب مكلفة.
تقدم هذه الورقة HAMMER، وهو مقايسة خلوية تعتمد على اللمعان وتتميز بالسرعة والقابلية للتوسع والنوعية، والتي تقيس نشاط تحرير الحمض النووي الريبي (RNA) بوساطة APOBEC3A عن طريق قياس تحول نمط CGA إلى كودون إيقاف UGA، مما يتيح توصيف كل من النشاط الإنزيمي والمثبطات.
تكشف هذه الدراسة أن بروتين MRE11 يثبط الطفرات الجينية في الخلايا الإنتاشية لدى الفئران عن طريق منع عملية الالتحام النهائي عرضة للخطأ لكسور الحمض النووي مزدوجة الشريط المتقاربة، وهي عملية تؤدي بخلاف ذلك إلى حدوث عمليات حذف مجهرية ومتغيرات بنيوية، لا سيما عندما يختل مسار إشارات كيناز ATM.
تستخدم هذه الدراسة تسلسل الجيل التالي عالي الإنتاجية للكشف عن فيروم الحمضيات الإسباني الأكثر تعقيداً مما كان معروفاً سابقاً، حيث حددت الحالات الأولى لظهور فيروس الحمضيات (أ) والنمط الجيني T3 من فيروس تريستيزا للحمضيات إلى جانب فيروس تصفية العروق الصفراء للحمضيات، مما يسلط الضيد على الدور الحاسم للمراقبة المتقدمة في اكتشاف التهديدات الناشئة لصناعة الحمضيات.
تحدد الورقة البحثية البروتين النووي Nup42 كعامل رئيسي يمنع تكتل الرنا المرسال (mRNA) الخاص بالمرافقات الجزيئية الناتج عن الحرارة، مما يضمن ذوبانه وترجمته بكفاءة لدعم استجابة الصدمة الحرارية الخلوية.
من خلال توليد طفرات توافقية لمختلف بروتينات قارئة الميثيل ومسارات الإسكات، تُظهر الدراسة أن آليات متعددة وفائضة تعمل بشكل تعاوني لتفسير غالبية عملية إسكات الجينات بوساطة ميثيلة الحمض النووي والحفاظ على تنظيم الجينوم ثلاثي الأبعاد.
تُظهر هذه الدراسة أنه بينما يُعد بروتين التنظيم CsrA/RsmA وآلية ارتباطه بالحمض النووي الريبوزي (RNA) محفوظين للغاية عبر مختلف أنواع البكتيريا من طائفة "غاما-بروتيوبكتيريا" ({gamma}-proteobacteria)، فإن أهداف الحمض النووي الريبوزي المرسال (mRNA) المحددة التي ينظمها قد تباينت بشكل كبير من خلال إعادة صياغة تنظيمية تطورية للتكيف مع مناخات بيئية متميزة، حيث يتم تشكيل الوظائف النوعية لكل مناخ مثل الضراوة والاستجابة للإجهاد البيئي من خلال الطفرات في الجينات المستهدفة بدلاً من التغيرات في البروتين التنظيمي نفسه.
تُظهر هذه الدراسة أن تحرير القواعد الأدينين الذي يستهدف إطار القراءة المفتوح المتداخل لـ HBs/البوليميراز يثبط بقوة تعبير مستضد السطح لفيروس التهاب الكبد بي وتضاعف الفيروس من خلال تعطيل كل من الحمض النووي التساهمي الدائري (cccDNA) والحمض النووي المدمج لفيروس التهاب الكبد بي، مع تثبيط إطلاق فيروس التهاب الكبد دلتا في الوقت ذاته في كل من النماذج المختبرية والداخل حيوية.